Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD8BP10966 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD8BP10966 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms