Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH16O75452 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RDH16O75452 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH16O75452 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH16O75452 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH16O75452 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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