Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms