Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3CA6NKF2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3CA6NKF2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms