Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms