Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SORCS3Q9UPU3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms