Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms