Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms