Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L1Q9NU39 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms