Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRCC1Q9NPI7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms