Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN1Q9BY11 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms