Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SSBP4Q9BWG4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms