Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms