Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms