Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELQQ8TDG4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms