Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms