Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms