Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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