Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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