Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms