Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM29Q86T20 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM29Q86T20 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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