Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYT9Q86SS6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYT9Q86SS6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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