Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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WDR53Q7Z5U6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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