Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms