Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC80Q76M96 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms