Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms