Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZCCHC12Q6PEW1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms