Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CARMIL2Q6F5E8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms