Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms