Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF17Q5VTA0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms