Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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