Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms