Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGSM1Q2NKQ1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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