Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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