Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms