Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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