Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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