Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRNQ16849 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRNQ16849 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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