Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HIST3H3Q16695 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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