Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SCN9AQ15858 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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SCN9AQ15858 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SCN9AQ15858 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SCN9AQ15858 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCN9AQ15858 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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