Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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