Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA3AQ14563 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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