Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCOA4Q13772 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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