Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms