Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1SQ13698 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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