Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FHL3Q13643 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms