Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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C1orf61Q13536 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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C1orf61Q13536 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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C1orf61Q13536 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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C1orf61Q13536 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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C1orf61Q13536 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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C1orf61Q13536 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms