Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXE3Q13461 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXE3Q13461 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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