Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SP140Q13342 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SP140Q13342 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SP140Q13342 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SP140Q13342 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SP140Q13342 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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