Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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